基因組測序技術有哪些,DNA測序技術有哪些?

2021-03-04 04:53:32 字數 3324 閱讀 2856

1樓:匿名使用者

提取基因組dna,然後隨機打斷,電泳**所需長度的dn**段(0.2~5kb),加上接頭, 進行基因簇cluster製備或電子擴增e-pcr,最後利用paired-end(solexa)或者mate-pair(solid)的方法對插入片段進行測序。然後對測得的序列組裝成contig,通過paired-end的距離可進一步組裝成scaffold,進而可組裝成染色體等。

組裝效果與測序深度與覆蓋度、測序質量等有關。常用的組裝有:soapdenovo、trimity、abyss等。

dna測序技術有哪些?

2樓:北京理工大學出版社

dna的序列分析是進一步研究和改造目的基因的基礎。目前用於測序的技術主要有sanger等(1977)發明的雙脫氧鏈末端終止法與gilbert(1977)發明的化學降解法。這兩種方法在原理上差異很大,但都是根據核苷酸在某一固定的點開始,隨機在某乙個特定的鹼基處終止,產生a,t,c,g四組不同長度的一系列核苷酸,然後在尿素變性的page膠上電泳進行檢測,從而獲得dna序列。

目前sanger測序法得到了廣泛的應用。

一代測序技術包括哪些?

3樓:匿名使用者

包括sanger測序,str親子鑑定、法醫鑑定,snapshot測序技術,實時螢光定量pcr。

上個世紀末90年代,與「曼哈頓原子彈計畫」和「阿波羅登月計畫」具有同樣劃時代意義的「人類基因組計畫」啟動,這是人類第一次在分子水平上全面地認識自我。隨著人類基因組計畫的開展,人們對基因與疾病的關係認識更加深入,有機會通過對基因缺陷的檢測分析來判斷各種疾病發生的風險,並由此衍生出一種新的健康服務專案—基因測序。

sanger測序經過38年的發展已相當完善,成本也降低了10倍以上,現在國際上仍然是基因測序行業的金標準和主力軍。sanger測序是目前所有基因測序的國際金標準,是包括螢光定量pcrtaqman探針法、普通pcr法、晶元法、二代測序法、質譜法等方法的金標準。

2023年以來,出現了很多新一代測序儀產品,新一代測序成本低、資料大、速度快,但都有待成熟,準確度不夠高。

(一)、sanger測序

被檢測的dna鹼基順序依次讀出800bp以上,是一代所有測序和新一代所有測序的金標準。代表儀器美國abi3730xl,sanger測序一般醫院很少開展,開展的都發公司做。耗時長達 13年之久的人類基因組計畫也是依靠sanger測序法才得以最終完成的。

sanger 測序是針對已知致病基因的突變位點設計引物,進行pcr 擴增直接測序。單個突變點的擴增(包括該位點在內的外顯子部分片段的擴增),不必將該點所在基因的全部外顯子都擴增。所以單基因或部分基因控制的疾病樣本檢測,sanger 測序可以發揮精準和成本低的優勢。

(二)、str親子鑑定、法醫鑑定

通過測定dn**段的長度和顏色,來確定遺傳關係。是sanger測序技術基礎上,發展起來的乙個技術,所用儀器與sanger測序所用儀器一樣,檢測原理一樣,一台裝置裝兩套檢測軟體,一台儀器具有三個功能。代表儀器美國abi 3130、3130xl、3730儀器,一般司法機構和sanger測序公司擁有該儀器,醫院沒有。

親子鑑定就是通過對dna遺傳片段檢測,判定父母與子女之間的親緣關係。

(三)、snapshot測序技術

snapshot技術是美國應用生物公司(abi)開發,是螢光標記單鹼基延伸的分型技術,也稱小測序,主要針對中等通量的snp突變分型專案檢測。通常用於10~30個snp突變位點分析。是sanger測序技術基礎上,發展起來的乙個技術,和sanger測序儀器一樣,檢測原理一樣,一台裝置裝有兩套檢測軟體,一台儀器具有三個功能。

代表儀器美國abi3130、3130xl、3730儀器,一般sanger測序公司擁該有儀器。

優勢:1、分型準確,2、通量高,3、檢測速度快,4、不受snp位點多型性特性限制,5、不受樣本個數限制。snapshot技術是新一代測序技術(包括二代測序和晶元測序)snp突變檢測的金標準,sanger測序技術又是snapshot技術突變檢測的金標準。

(四)、實時螢光定量pcr

利用螢光訊號積累實時監測整個pcr過程,最後通過標準曲線(或者與內參對照)對未知模板進行定量分析。代表儀器美國abi 7500螢光定量pcr儀等,一般三甲醫院都有該類儀器,普及較好。使用方便維護簡單。

1、突變尋找:定量pcr taqman探針雜交。2、基因定量:

相對螢光定量pcr,醫學上用來檢測細菌或病毒rna的表達量。螢光定量pcr是1996 年由美國abi 公司推出的一種新定量實驗技術。

實時螢光定量pcr應用領域:臨床疾病診斷:各型肝炎、愛滋病、禽流感、結核、性病等傳染病診斷和療效評價,地中海貧血、血友病、性別發育異常、智力低下綜合症、胎兒畸形等優生優育檢測,腫瘤標誌物及瘤基因測序,遺傳基因測序。

dna測序技術是什麼?

4樓:廣西師範大學出版社

dna的序列分析是進一步研究和改造目的基因的基礎。目前用於測序的技術主要有sanger等(1977)發明的雙脫氧鏈末端終止法與gilbert(1977)發明的化學降解法。這兩種方法在原理上差異很大,但都是根據核苷酸在某一固定的點開始,隨機在某乙個特定的鹼基處終止,產生a,t,c,g四組不同長度的一系列核苷酸,然後在尿素變性的page膠上電泳進行檢測,從而獲得dna序列。

目前sanger測序法得到了廣泛的應用。

dna測序方法有哪些

5樓:匿名使用者

第1 代測序技術——螢光標記的sanger 法第一代就不說了。

第2 代測序技術——迴圈陣列合成測序法

述第2 代測序技術中, 序列都是在螢光

或者化學發光物質的協助下, 通過讀取dna 聚合酶或dna 連線酶將鹼基連線到dna 鏈上過程中釋放出的光學訊號而間接確定的. 除了需要昂貴的光學監測系統, 還要記錄、儲存並分析大量的光學影象.

這都使儀器的複雜性和成本增加. 依賴生物化學反應讀取鹼基序列更增加了試劑、耗材的使用, 在目前測序成本中比例相當大. 直接讀取序列資訊, 不使用化學試劑, 對於進一步降低測序成本是非常可取的.

在乙個正在發生突破瓶頸巨變的領域內, 很難準確**未來將發生什麼.

第3 代測序技術——直接測序

將基因組dna 隨機切割成大約100 kb 左右的片段,製成單鏈並與六寡聚核苷酸探針雜交. 然後驅動結合了探針的基因組文庫片段通過可定址的奈米孔陣列. 通過每個孔的離子電流均可獨立測量.

追蹤電流的變化確定探針雜交在每個基因組片段上的精確位置. 利用基因組片段上雜交探針的重疊區域將基因組片段文庫排列起來, 建立一組完整的基因組探針圖. 利用計算機演算法, 獲得完整的基因組序列.

6樓:匿名使用者

主要的是雙脫氧測序,是最經典的

現在測序方法已發展到第三代,可實現高通量測序

基因組測序技術有哪些?

高太監們打算找誰當始祖?這方法找祖先沒用。現在時髦的 nextgen sequencing 技術,在 wiki 上一查,有十數個。這面提的這個是第 6 個。基本概念還是挺清楚的。用加入乙個新 nucleotide 時的 ph 值變化來測,而不是 ligate,掃瞄照相,切割這樣的複雜過程,據說速度就...

如何評價基因組測序的序列質量

有統計學的方法,但是關鍵在於就算測了人類的基因組,也不是乙個或者某個人的完整基因組,現在的技術還達不到那種沒有洞的精確程度。人類基因組測序出來不過是個框架,不能解釋所有的問題,只能說進步了。中國天體生物學 這個好像真沒有。國內圖書館這方面的中文書都沒有,不過國外這個方向已經弄得比較好了,一些著名的大...

現在國家政策允許做病人的全基因組測序嗎

可以做,但不允許出醫學報告,科研性質,可以檢測個人的全基因組序列。不允許,也沒那能力,全基因組得多長啊 為什麼現在做全基因組測序都可以了,還是找不到精神病 引起精神病的原因非常複雜,有遺傳因素,也有後天因素,遠不是乙個二個基因的問題。全基因組測序的意義是什麼?全基因組測序的意義是使人類從根本上認知疾...