1樓：
基因組調研圖研究是對於沒有基因組參考序列的物種，基於小片段文庫的低深度測序資料，可以有效地評估基因組大小、gc含量、雜合度高低以及重複序列含量等資訊，是全面了解某一物種基因組特徵的有效方法；此外，通過基因組調研分析也可對基因組進行初步組裝。
專案週期：
動植物基因組survey開發時間為6周；3個樣品或以上，以及基因組大於1g為2個月。
開發時間以樣品到位並檢測合格為前提；收到樣品後，需要對樣品進行檢測，最終樣品的量和純度，以公司的檢測結果為準。
測序平台及策略：
整體測序深度不低於30倍覆蓋度；
**基因組大小，評估基因組gc含量，評估基因組雜合率；
確定精細圖梯度文庫構建具體策略
技術路線：
分析內容：
1.標準資訊分析
資料基本處理，去低質量和接頭序列；
k-mer 分析以及基因組大小估計；
雜合率估計；
精細圖建庫方案評估；
2.高階資訊分析（只針對純調研圖專案）
初步組裝；
gc-depth 分布分析，判斷測序偏好性；
ssr標記鑑定；
樣品間snp鑑定（多樣本情況下）。
如何利用全基因組重測序比較兩個樣品之間的差異
2樓：匿名使用者
基因測序主要用於基因工程,通過基因測序我們可以知道植物體中控制某種蛋白質合成的dn**段的鹼基序列,知道了鹼基序列就可以人工合成並大量擴增,根據需要應用於基因工程.也可以用蛋白質工程的技術對其進行改造,製造出功能更完美,更能滿足人類需要的蛋白質.
測序為什麼有兩個fastq檔案
3樓：匿名使用者
是不是序列太長分成兩部分測了？
一般會給兩個檔案：乙個是序列檔案，乙個是峰**件。
4樓：子木
是雙端測序吧，雙端測序兩個很正常
如何在轉錄組deg資料中判斷兩個樣本之間是有差異的
5樓：
只有一組資料無法判斷資料有無顯著性差異
只能做出這組資料的平均離差、標準差、方差、平均數等等統計量
差異基因分析pvalue，fdr是怎麼計算的
6樓：迷途崽崽
在利用rna-seq資料比較分析兩個樣品中同乙個基因是否存在差異表達的時候，一般選取兩個標準：
i）foldchange
foldchange，很容易理解了。就是兩樣品中同乙個基因表達水平的變化倍數。可以用rpkm值來計算，關於rpkm的計算方法，請參考 ii）fdr校正後的p-value，即q-valuefdr值的計算方法如下： 1）對每個基因進行p-value的計算 假設觀測到基因a對應的reads數為x，已知在乙個大文庫中，每個基因的表達量只佔所有基因表達量的一小部分，在這種情況下，p(x)的分布服從泊松分布。已知樣本一中唯一比對到基因組的總reads數為n1，樣本二中唯一比對到基因組的總reads數為n2，樣本一中唯一比對到基因a的總reads數為x，樣本二中唯一比對到基因a的總reads數為y，則基因a在兩樣本中表達量相等的概率可由以下公式計算： 成語是 卑梁之釁。春秋時期，吳國的邊境城邑卑梁和楚國的城邑鍾離一界之隔，雞犬相聞。一天，卑梁與鍾離的兩個女孩一起採桑葉時，因爭搶桑葉發生了口角。兩家大人聽說後隨即趕到了出事地點，先是相互指責對方，既而大打出手，結果鍾離的人打死了卑梁的人。為此，卑梁的百姓怒不可遏，守城的長官還帶領大兵掃蕩了鍾離。楚平... 片 pi n 平而薄的物體 卡 名 切削成薄的形狀 肉片。少,零星 段 整體當中的一段 刻。面。甲不存。指較大地區內劃分的較小地區 分 兒開會。假名 日本文所用的楷書字母。量詞，指面積 範圍 景象 心意等或成片的東西 兩 藥。一 新氣象。片 pi n 義同 一 用於 相片兒 電影片兒 等。為 兩個讀... 並列詞語間如果沒有停頓，就既不用逗號，也不用頓號。例如 他的父母很愛他 父 母 之間就不必用頓號或逗號。類似的例子還有 公安 幹警 中小 學生 解放軍 指戰 員 如果並列詞語之間有停頓，一般用頓號表示，有時也可以用逗號表示。如果停頓比較長，就用逗號，停頓比較短，則用頓號。停頓的長短寫文章的人可以自由...成語 兩個孩子大家引發兩個國家之間的戰爭
區分片的兩個讀音,為兩個讀音的區分方法
兩個並列的詞要加頓號嗎,兩個並列的詞之間可以用頓號嗎