microrna干擾,與傳統rnai相比有何優勢

2021-03-04 05:58:54 字數 680 閱讀 6842

1樓:匿名使用者

基因和microrna有多個結合位點

合生基因構建的mirna sponge抑制載體,經特異地優化設計,增強吸附能力的同時增加了更多的結合位點,這樣提高了成熟mirna或sirna抑制能力,消弱細胞中mirna或sirna導致的基因沉默效應,從而進行mirna或sirna功能缺失性研究。

最近進行課題設計,想驗證一下microrna和**的靶基因是否結合。同時在靶基因3『-utr區的snp是否影響它們的關係。這個snp位點在種子區,推測也具有一定功能。

第一步想轉殖microrna到表達載體,同時轉殖3』-utr區(包括野生型和突變型)到pgl-3 control 螢光素酶基因下游,雙轉細胞後,利用螢光素酶報告系統檢測兩者是否結合,snp位點是否影響結合。

請問具體的實驗設計:

選取什麼細胞系進行實驗,是靶基因和mirna內源表達高的,還是低的。細胞系的基因型是否影響實驗結果?

2.我選用的載體是否合適,mirna如果已有慢病毒的表達載體(商品),是否可以直接利用,還是需要重新做?pgl-3 control是否可以?

有無合適的位點供轉殖,只發現xbai。內對照用pgl-tk,因為不是很熟悉這套載體,不知選的是否合適。

3.如果驗證成功,還需什麼實驗佐證,後續的功能研究如何進行?是否也需要用rnai的方法抑制靶基因表達,再轉入野生型和突變性兩種基因,看效果?

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