對基因進行生物資訊學分析是不是利用CDS區就可以了

2021-03-04 05:52:38 字數 1214 閱讀 5788

1樓:匿名使用者

基因發揮功能具有時空特異性。cds提供的是基因的編碼區資訊,可推根據同源性測其功能和是否分泌到胞外等。但基因什麼時候表達?

在什麼部位表達?這些資訊則位於基因上游的啟動子和調控序列之中。因此,僅僅分析cds還不夠全面。

2樓:劉念

主要包含的資訊中的dna和氨基酸序列分析的生物資訊學。多序列比較分析它們的相似性,基因結構的**可以**二級**結構的蛋白質。如果你知道乙個基因的編碼區可以成為他的稀有密碼子的分析,以幫助選擇合適的表達載體。

未來,你可以做老師,教了學校類生物的興趣,研究人員可以做生物資訊學研究。這是乙個非常有趣的過程。

對一種疾病相關基因或其他感興趣的基因進行生物資訊學分析

3樓:匿名使用者

樓主的問題問的太寬泛了。請問你是具體問題出在**呢?你可以利用biomart這個工具(****biomart.***

),找到種間的orthlogue關係以及各種型別的註釋id直接的對應關係。你也可以用ncbi裡面的homologene資料庫去找種間的同源序列.multiple alignment可以用clust w或者mega做。

系統發育樹可以用mega做。phylip好像也可以。基因結構上可以做做gc含量,外顯子大小,splicing,調控序列什麼的蛋白結構**軟體很多,不過我沒做過。

ncbi有乙個conserved domain 的資料庫,你可以和他比較下,分析下結構域。表達情況。。。。你可以找找相關的est(ncbi)或者array(。。

這個不記得了,在ncbi上應該有別人的資料)的表達資料。

如何利用生物資訊學分析乙個基因的dna序列

4樓:匿名使用者

基因轉殖是70年代發展起來的一項具有革命性的研究技術,可概括為∶分、切、連、轉、選。最終目的在於通過相應技術手段,將目的基因匯入寄主細胞,在宿主細胞內目的基因被大量的複製。

"切"是指用序列特異的限制性內切酶切開載體dna,或者切出目的基因;"連"是指用dna連線酶將目的dna同載體dna連線起來,形成重組的dna分子;"轉"是指通過特殊的方法將重組的dna分子送入宿主細胞中進行複製和擴增;"選"則是從宿主群體中挑選出攜帶有重組dna分子的個體。基因工程技術的兩個最基本的特點是分子水平上的操作和細胞水平上的表達,而分子水平上的操作即是體外重組的過程,實際上是利用工具酶對dna分子進行"外科手術"。

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